University of Alicante

JULIA M. ESCLAPEZ ESPLIEGO

PERSONAL DATA

Dpt. of Agrochemistry and Biochemistry
Senior Lecturer
e-mail: julia.esclapez@ua.es
Phone: 965903400 x 1382

Brief summary of work: Analysis of structural and molecular determinants of halophilic adaptation and other extreme environments. Expression of extremophile proteins, crystallization and structure resolution. Protein engineering. Transcriptomics. Studies regulating gene expression at transcriptional level and metabolism of RNA.

Abridged CV

UNIT OF RESEARCH 1

Structural and molecular analysis of organisms

RESEARCH LINES

• Extremophilic Enzyme Biotechnology

-production of enzyme and metabolites of biotechnology interest

-design of biocatalysts with wide range of substrate utilization and thermal stability 

-expression and Determination of 3d structures of halophilic protein

• Genomics, proteomics and transcriptomics of organisms extremophiles 

-Proteomics of microorganisms Halofílicos 

-Analysis of gene expression by microarray and RNA-seq 

-Studies of gene regulation 

-Gene Regulatory network analysis

• Metabolism of nitrogen and carbon in Haloarchaeas 

-Study of enzymes involved in the metabolism of nitrogen and carbon 

-Identification of transcriptional regulators involved in the metabolism of nitrogen and carbon 

• RNA metabolism

-Identification and characterization of small RNAs 

-Identification and study of proteins involved in RNA metabolism (Sm family)

• Biology Systems 

-Study of gene regulatory networks in extremophiles microorganisms 

• Use of molecular markers as quality control 

-Obtain valid molecular markers for the identification of varieties of Almonds used in the manufacture of nougat and marzipan 

• Elaboration of artisanal beer: enzymes 

-Development of methods for the determination of metabolites in artisanal beers

RESEARCH GROUP

Extremophile biotechnolgy

PROJECTS:

• Biotecnología de Extremófilos (BIOTECEXTREM) (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 593,00 €. Duración: 2018.
  
  
• Ayuda por difusión de resultados de investigación por grupo investigación (UADIF17-05). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 644,00 €. Duración: 2018.
  
  
• Biotecnología de Extremófilos (BIOTECEXTREM) (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 1.068,00 €. Duración: 2017.
  
  
• Biotecnología de Extremófilos (BIOTECEXTREM) (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 1.067,00 €. Duración: 2016.
  
  
• Biotecnología de Extremófilos (BIOTECEXTREM) (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 1.131,00 €. Duración: 2015.
  
  
• Contribución de las haloarqueas en cambio climático, innovación en tecnologías de tratamiento de aguas residuales y usos de la biomasa generada (CTM2013-43147-R). Entidad financiadora Ministerio de Economía y Competitividad. Investigador responsable: MARTINEZ ESPINOSA, ROSA MARIA. Cuantía: 124.630,00 €. Duración: 2014-2017.
  
  
• Biotecnología de Extremófilos (BIOTECEXTREM) (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 1.065,00 €. Duración: 2014.
  
  
• Adaptaciones metabólicas de haloarqueas en respuesta a diferentes condiciones nutricionales (BIO2013-42921-P). Entidad financiadora: Ministerio de Economía y Competitividad. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 84.700,00 €. Duración: 2014-2017.
  
  
• Análisis transcriptómico de Haloferax mediterranei (AEST/2013/062). Entidad financiadora: Conselleria de Educación, Formación y Empleo. Investigador responsable: ESCLAPEZ ESPLIEGO, JULIA MARIA. Cuantía: 6.000,00 €. Duración: 2013.
  
  
• Proteínas de extremófilos (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 1.274,00 €. Duración: 2013.
  
  
• Proteínas de extremófilos (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 2.042,00 €. Duración: 2012.
  
  
• Proteínas de extremófilos (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 2.561,00 €. Duración: 2011.
  
  
• Desnitrificación en haloarchaeas: complejos proteicos para la respiración de nitrato (GV/2011/038). Entidad financiadora: Consellería de Educación. Investigador responsable: MARTINEZ ESPINOSA, ROSA MARIA. Cuantía: 2.561,00 €. Duración: 2011-2012.
  
  
• Desnitrificación en haloarchaeas: complejos proteicos para la respiración de nitrato (GRE09-25). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: MARTINEZ ESPINOSA, ROSA MARIA. Cuantía: 7.500,00 €. Duración: 2010-2013.
  
  
• Proteínas de extremófilos (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 3.648,00 €. Duración: 2010.
  
  
• Genómica y proteómica para el estudio de la regulación de la asimilación del nitrógeno en arqueas halofílicas (ACOMP/2010/049). Entidad financiadora: Consellería de Educación. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 7.000,00 €. Duración: 2010.
  
  
• Proteínas de extremófilos (VIGROB-016). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 4.235,00 €. Duración: 2009.
  
  
• Genómica y proteómica para el estudio de la regulación de la asimilación del nitrógeno en arqueas halofílicas (BIO2008-00082). Entidad financiadora: Ministerio de Educación y Ciencia. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 133.100,00 €. Duración: 2009-2011.
  
  
• Asimilación de Amonio en Haloferax mediterranei: Ciclo Glutamina Sintetasa/Glutamato sintasa (GRJ06-10). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA. Cuantía: 6.126,00 €. Duración: 2007.
  
  
• Biología molecular de halófilos (VIGROB-151). Entidad financiadora: Universidad de Alicante. Investigador responsable: PIRE GALIANA, CARMEN LUCIA. Cuantía: 763,27 €. Duración: 2006-2008.
  
  
• Análisis de los determinantes estructurales de la estabilidad de proteínas halofílicas (BIO2005-08991-C02-01). Entidad financiadora: Ministerio de Educación y Ciencia. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 124.950,00 €. Duración: 2005-2008.

Private:

• Desarrollo de un microarray de expresión génica para Haloferax mediterrani (BIOARRAY2-10D). Entidad financiadora: BIOARRAY, S.L. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 2.000,00 €. Duración: 2 meses (2010).
  
  
• Desarrollo de un microarray de expresión génica para Haloferax mediterrani (BIOARRAY2-10D). Entidad financiadora: BIOARRAY, S.L. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 5.300,00 €. Duración: 2 meses (2010).
  
  
• Desarrollo de un microarray de expresión génica para Haloferax mediterrani (BIOARRAY2-09I). Entidad financiadora: BIOARRAY, S.L. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 5.810,00 €. Duración: 3 meses (2009-2010).
  
  
• Desarrollo de un microarray de expresión génica para Haloferax mediterrani (BIOARRAY1-09I). Entidad financiadora: BIOARRAY, S.L. Investigador responsable: BONETE PEREZ, MARIA JOSE. Cuantía: 1.500,00 €. Duración: 3 meses (2009).

RECENT PUBLICATIONS

UA Institutional Repository: http://rua.ua.es/dspace/handle/10045/162?locale=en

Book chapters:

• Esclapez, J., Bautista, V., Bonete, M.J., Camacho, M., Díaz-González, S., Martínez Espinosa, R.M., Pérez Pomares, F., Pire, C. (2007). Práctiques de Mecanismes Moleculars de la Funció Cel·lular. Ed. Universidad de Alicante. Pp. 99. ISBN: 978-84-7908-942-9.
  
  
• Esclapez J., Díaz-González, S., Camacho, M., Bautista, V., Martínez Espinosa, R.M., Pire, C., Bonete, M.J. (2013). Pràctiques de Bioquímica: Estudis de Grau i Màster en Biomedicina. Ed. Universidad de Alicante. Pp.71. ISBN: 978-84-9717-277-6.
  
  
• Bonete, M.J.; Camacho, M.; Martínez-Espinosa, R.M.; Esclapez, J.; Bautista, V.; Pire, C.; Zafrilla, B.; Díaz, S.; Pérez-Pomares, F.; Llorca, F. (2007). In the light of the haloarchaea metabolism. En: Communicating Current Research and Educational Topics and Trends in Applied Microbiology / Méndez Vilas, A. / Formatex. Pp. 170-183. ISBN: 978-84-611-9422-3.
  
  
• Orts Cortés M.; Sanjuán Quiles, A.; Gil González, D.M.; Martínez-Espinosa, R.M.; Ferrer D.R.; Pérez Cañaveras, R.M.; Moncho Vasallo, J.; Richard Martínez, M.; Angulo Jerez, A.; Antón Botella, J. (2008). Comparación e integración de guías docentes. Primer curso de la Titulación de Enfermería. En: Aportaciones curriculares para la interacción en el aprendizaje (Vol. 3). / Merma, G.; Pastor, F.; Morell, T. / Editorial Marfil. Pp. 465-492. ISBN: 978-84-268-1386-2.
  
  
• Pire, C.; Martínez-Espinosa, R.; Esclapez, J., Pérez-Pomares, F.; Bonete, M.J. (2009). Secuenciación y caracterización de glutamato sintasa de Haloferax mediterranei. En: AVANCES EN EL METABOLISMO DEL NITRÓGENO: de la genómica y la proteómica a las aplicaciones agronómicas, industriales y medioambientales. / Bonete, M.J.; Martínez-Espinosa, R.M. / Editorial Club Universitario. Pp. 137-146. ISBN: 978-84-8454-806-5.
  
  
• Marhuenda-Egea, F.C.; Esclapez Espliego, J.; Hernández Alarcón, J.A.; Martínez-Espinosa, R.M.; Pire C. (2010). Red para la elaboración de guías docentes para la asignatura de Bioquímica en las titulaciones de Ciencias de la Salud. En: La comunidad universitaria: tarea investigadora ante la práctica docente / Álvarez, J.D.; Tortosa, M.T.; Pellín, N. (coords) / ICE/ Vicerrectorado de Estudios e Innovación Educativa, Universidad de Alicante. Pp. 183-217. ISBN: 978-84-693-9262-1.
  
  
• Esclapez, J.; Camacho, M.; Pire, C.; Bonete, M.J. (2013). Biochemical Analysis of Halophilic Dehydrogenases Altered by Site-Directed Mutagenesis. En: Genetic Manipulation of DNA and Protein: Examples from Current Research / Figurski, D. Editor / Intech. Pp. 17-42. ISBN: 978-953-51-0994-5.
  
  
• Bonete, Mª.J.; Martínez-Espinosa, R.Mª; Pire Galiana, C.L.; Esclapez Espliego, J.Mª; Camacho Carrasco, M.L. (2013). Biochemistry teaching in high academic achievement groups/Docencia de Bioquímica en grupos de alto rendimiento académico (ARA). En: Diseño de acciones de investigación en docencia universitaria / Álvarez, J. D.; Tortosa, M. T. y Pellín, N. (coords.) / ICE/Vicerrectorado de Estudios e Innovación Educativa, Universidad de Alicante. Pp. 2832-2846. ISBN: 978-84-695-6638-1.
  
  
• Bonete, M.J.; Bautista, V.; Esclapez,J.; García-Bonete, M.J.; Pire, C.; Camacho, M.; Torregrosa-Crespo, J.; Martínez-Espinosa, R.M. (2015). New Uses of Haloarchaeal Species in Bioremediation Processes. En: Advances in Bioremediation of Wastewater and Polluted Soil / Prof. Naofumi Shiomi (Ed.) / Intech. Pp. 23-49. ISBN: 978-953-51-2165-7.
  
  
• Marhuenda Egea, F.C.; Esclapez Espliego, J.; Bonete Ferrández, P.; Bautista Saiz, V.; Hernández Alarcón, J.A. (2016). Mejora en la docencia en biociencias mediante la metodología basada en resolución de problemas. En: Investigación e Innovación Educativa en Docencia Universitaria. Retos, Propuestas y Acciones / Roig-Vila, R., Blasco Mira, J., Lledó Carreres, A.& Pellín Buades, N. (Eds.) / Instituto de Ciencias de la Educación. Pp. 2328-2343. ISBN: 978-84-617-5129-7.
  
  
• Esclapez,J; Camacho, M.; Pire, C.; Bautista, V.; Vegara, A.; Pedro-Roig, L.; Pérez-Pomares, F.; Martínez-Espinosa, R.M.; Bonete, M.J. (2016). Recent Advances in the Nitrogen Metabolism in Haloarchaea and Its Biotechnological Applications. En: Biotechnology of Extremophiles:Advances and Challenges. / Rampelotto, Pabulo H (Ed.) / Springer. Pp. 273-301. ISBN: 978-3-319-13520-5.
  
  
• Fernández, E.; Martínez, R. M.; Esclapez, J.; Garmendia, I.; Espinosa, J.; Martínez, E.; Sánchez, A.; Mulero, J.; Pérez, A.; Gras, L. (2016). PAT Ciencias: Actividades del Programa de Acción Tutorial de la Facultad de Ciencias. En: Investigación e Innovación Educativa en Docencia Universitaria. Retos, Propuestas y Acciones / Roig-Vila, R., Blasco Mira, J., Lledó Carreres, A.& Pellín Buades, N. (Eds.) / Instituto de Ciencias de la Educación. Pp. 3106-3120. ISBN: 978-84-617-5129-7.
  
  
• Torregrosa-Crespo, J; Martínez-Espinosa, R.M.; Esclapez, J.; Bautista, V.; Pire, C.; Camacho, M.; Richardson, D.J.; Bonete, M.J. (2016). Anaerobic metabolism in Haloferax genus: denitrification as case of study. En: Advances in microbial physiology: advances in bacterial electron transport systems and their regulation / Elsevier Science. Pp. 41-86. ISBN: 978-0-12-804823-8.
  
  
• Mª Ángeles Alonso Vargas; María José Bonete Pérez; Santiago Bordera Sanjuán; Julia Esclapez Espliego; José Luis Girela López; Aitor Forcada Almarcha; Carlos Martín Cantarino; Isidro Pastor Beviá; Paloma Salinas Berna. (2017). Revisión de la renovación de la acreditación de la Titulación en el Grado en Biología de la FC. de la UA. Reflexiones sobre las valoraciones aportadas y creación de un Plan de mejora. En: Memorias del Programa de Redes-I3CE de calidad, innovaci%u04DBn e investigaci%u04DBn en docencia universitaria. Convocatoria 2016-17 / Roig-Vila, R. (Coord.), Antolí martínez, J., Lledó Carreres, A. & Pellín Buades (Eds.) / Instituto de Ciencias de la Educación (ICE) de la Universidad de Alicante. Pp. 640-653. ISBN: 978-84-697-6536-4.

Papers:

• Esclapez, J.; Pire,C; Bautista, V.; Martinez-Espinosa, R.M.; Ferrer, J.; Bonete, M.J. (2007). "Analysis of acidic surface of Haloferax mediterranei glucose dehydrogenase by site-directed mutagenesis". FEBS Letters 581(5): 837-842.
  
  
• Baker,P; Britton, K.; Fisher, M.; Esclapez, J.; Pire, C.; Bonete, M.J.; Ferrer, J.; Rice, D.W. (2009). Active site dynamics in the zinc-dependent medium chain alcohol dehydrogenase superfamily. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106(3): 779-784.
  
  
• Pérez-Pomares, F.; Díaz, S.; Bautista, V.; Pire, C.; Bravo, G.; Esclapez, J.; Zafrilla, B.; Bonete, M.J. (2009). Identification of several intracellular carbohydrate degrading activities from the halophilic archaeon Haloferax mediterranei. Extremophiles 13(4): 633-641.
  
  
• Pire, C.; Esclapez, J.; Díaz, S.; Pérez-Pomares, F.; Ferrer, J.; Bonete, M.J. (2009). Alteration of coenzyme specificity in halophilic NAD(P) glucose dehydrogenase by site-directed mutagenesis. Journal of Molecular Catalysis B-Enzymatic 59(4): 261-265.
  
  
• Zafrilla, B.; Martínez-Espinosa, R.M.; Esclapez, J.; Pérez-Pomares, F.; Bonete, M.J. (2010). SufS protein from Haloferax volcanii involved in Fe-S cluster assembly in haloarchaea. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1804(7): 1476-1482.
  
  
• Bautista, V.; Esclapez, J.; Pérez-Pomares, F.; Martínez-Espinosa, R.M.; Camacho, M.; Bonete, M.J. (2012). Cyclodextrin glycosyltransferase: a key enzyme in the assimilation of starch by the halophilic archaeon Haloferax mediterranei. Extremophiles 16(1): 147-159.
  
  
• Esclapez, J.; Zafrilla, B.; Martínez-Espinosa, R.M.; Bonete, M.J. (2013). Cu-NirK from Haloferax mediterranei as an example of metalloprotein maturation and exportation via Tat system. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1834: 1003-1009.
  
  
• Esclapez, J.; Baker, P.; Rice, D. W.; Pire, C.; Ferrer,J.; Bonete, M.J. (2014). Study of zinc protein ligands in a halophilic enzyme. Current Topics in Peptide & Protein Research 15: 91-98.
  
  
• Pire, C.; Martínez-Espinosa, R.M.; Pérez-Pomares, F., Esclapez, J.; Bonete, M.J. (2014). Ferredoxin-dependent glutamate synthase: Involvement in ammonium assimilation in Haloferax mediterranei. Extremophiles 18(1): 147-159.
  
  
• Esclapez, J.; Bravo-Barrales, G.; Bautista, V.; Pire, C., Camacho, M.; Bonete, M.J. (2014). Effects of nitrogen sources on the nitrate assimilation in Haloferax mediterranei: growth kinetics and transcriptomic analysis. FEMS Microbiology Letters 350(2): 168-174.
  
  
• Esclapez, J.; Pire, C.; Camacho, M.; Bautista, V.; Martínez-Espinosa, R.M.; Zafrilla, B.; Vegara, A.; Alcaraz, L.A.; Bonete, M.J. (2015). Transcriptional profiles of Haloferax mediterranei based on nitrogen availability. Journal of Biotechnology 193: 100-107.
  
  
• Torregrosa-Crespo, J.; Pire, C.; Esclapez, J.; Camacho, M.; Bonete, M.J.; Martínez-Espinosa, R.M. (2015). Uses of haloarchaea in wastewater treatments combiing denitrification and nitrification processes. Journal of Earth Science & Climatic Change 6(5).
  
  
• Torregrosa-Crespo,J.; Martínez-Espinosa,R.M.; Esclapez, J.; Bautista,V.; Pire, C.; Camacho, M.; Richardson, D.J.; Bonete, M.J. (2016). Anaerobic Metabolism in Haloferax Genus: Denitrification as Case of Study. Advances in Microbial Physiology 68:41-85.
  
  
• Torregrosa-Crespo, J.; González-Torres, P.; Bautista, V.; Esclapez, J.M.; Pire, C.; Camacho, M.; Bonete, M.J.; Richardson, D.J.; Watmough, N.J.; Martínez-Espinosa, R.M. (2017). Analysis of multiple haloarchaeal genomes suggests that the quinone-dependent respiratory nitric oxide reductase is an important source of nitrous oxide in hypersaline environments. Environmental Microbiology Reports 9(6): 788-796.
  
  
• Payá, G.; Bautista, V.; Camacho, M.; Castejón-Fernández, N.; Alcaraz, L.A.; Bonete, M.J.; Esclapez, J. (2018). Small RNAs of Haloferax mediterranei: Identificationand Potential Involvement in Nitrogen Metabolism. Genes 9(2): 83.